Sintesis Bio, startup yang berbasis di Seattle yang didirikan oleh para pemimpin dari Fred Hutchinson Cancer Center, mengumumkan $ 10 juta dalam pendanaan dari Madrona Venture Group.
Perusahaan biotek bertujuan untuk membuat penemuan obat baru lebih cepat dan lebih murah dengan menggunakan kecerdasan buatan untuk mensimulasikan hasil dari tes laboratorium hipotetis. Tim membangun apa yang disebutnya model Genomics Foundation (GEM-1) untuk memprediksi ekspresi gen, memberikan wawasan tentang bagaimana obat baru diharapkan memengaruhi perilaku sel.
Pada hari Selasa, mensintesis peneliti bio menerbitkan pracetak pada Biorxiv yang menjelaskan model dan kinerjanya, yang menurut para ilmuwan “memprediksi hasil eksperimen ekspresi gen di masa depan dengan akurasi tingkat laboratorium.”
Sintesis Bio memiliki tim 16 orang dan didirikan bersama hampir dua tahun yang lalu oleh Kepala Data Fred Hutch Jeff Leek dan Robert Bradley, direktur Pusat Penelitian Terpadu Ilmu Data Tertegas di Fred Hutch.
Tim ini melatih modelnya tentang informasi yang tersedia untuk umum, eksperimen penelitian dengan data sekuensing RNA – yang menangkap gen yang diekspresikan dalam sel. Dataset termasuk sel dan jaringan manusia yang sehat dan sakit yang diambil dari pekerjaan laboratorium dan uji klinis.
“Ini adalah jenis perubahan infrastruktur yang mendefinisikan kembali apa yang mungkin dalam R&D sains hidup,” kata Matt McIlwain, direktur pelaksana di Madrona, di LinkedIn. “Dengan genomik generatif, para peneliti dapat mengajukan pertanyaan yang lebih berani, merancang uji coba yang lebih cerdas, dan menguji hipotesis yang sebelumnya tidak terjangkau atau tidak mungkin untuk dijelajahi.”
Dalam artikel preprint, tim sintesis diuraikan tentang masalah yang ingin dipecahkannya. “Banyak percobaan laboratorium tidak dapat dilakukan tidak lebih cepat daripada kecepatan yang tumbuh atau penyakit,” tulis perusahaan, “sementara uji klinis juga diatur oleh ketersediaan dan perekrutan peserta dan peraturan penting untuk melindungi pasien.”
Kemampuan generatif model AI, mereka melanjutkan, “menawarkan kemungkinan menghindari kendala biologis mendasar ini dengan secara komputasi mensimulasikan banyak, atau bahkan semua, membatasi langkah -langkah eksperimental.”
Sintesis bergabung dengan kesibukan startup biotek dan kelompok penelitian yang mengembangkan sistem bertenaga AI di daerah Seattle, termasuk:
- Institute of Washington’s Institute for Protein Design (IPD) menggunakan AI untuk membangun protein baru yang dapat digunakan dalam mengobati penyakit luas.
- Aliansi AI Cancer yang dipimpin Fred Hutch, sebuah konsorsium yang juga mencakup Dana-Farber, Memorial Sloan Kettering, dan Johns Hopkins dengan dukungan dari Allen Institute for AI (AI2) dan Google Cloud.
- Hub Seattle Allen Institute untuk hub sintetis, yang menggunakan teknologi berbasis DNA untuk membuat rekaman apa yang dialami sel dari waktu ke waktu.
- Startup termasuk Xaira Therapeutics, Archon Biosciences, Lila Biologics, Outpace Bio, A-Alpha Bio, Talus Biosciences, Kentang dan banyak lainnya. IPD sendiri telah memutar 10 startup.
Other authors of the preprint titled “Generative genomics accurately predicts future experimental results” are: Gregory Koytiger, Alice M. Walsh, Vaishali Marar, Kayla A. Johnson, Max Highsmith, Alexander R. Abbas, Andrew Stirn, Ariel R. Brumbaugh, Alex David, Darren Hui, Jeffrey M. Kahn, Sheng-Yong Niu, Liza J. Ray, Candace Savonen dan Stein Setvik.
